除了精彩的陆上活动，弗雷格特岛周边海域的水上活动也是精彩纷呈。如果渴望一探水下世界的神秘，岛上潜水中心的专业教练很乐于透露最好的潜点；此外岛上的潜水中心也提供PADI各种等级的潜水课程。为了维护海洋生态，弗雷格特岛上的水上设施几乎都采用环保模式。而渴望体验地道塞舌尔生活的人士，则不妨通过岛上服务中心的安排，跟随当地渔民，来上一回质朴的海上捕鱼之旅。
