在塞舌尔，土生土长的千奇百怪物种简直令人不可思议。除了这里，在世界上任何地方，人们都不可能见到海蜇树、塞舌尔天堂捕蝇草、世界上最小的青蛙、最重的陆龟、最大的鱼和印度洋仅存的不会飞的鸟。此外在塞舌尔群岛上还有世界上最壮观的海鸟群，其中有13种和17亚种海鸟也是仅此所有。
此外作为塞舌尔神奇物种代表的海椰子则生长在普拉兰岛和屈里厄斯岛上，一直被人们认为是“伊甸园”传说的化身。
作为塞舌尔国宝的海椰子果实是植物王国中最大、最重的种子，通常在10公斤左右，最重可达30多公斤。在其7-9个月大，果肉还是胶质状时方可食用，一旦超过9个月，果肉就会逐渐变硬。成熟的海椰子果肉洁白而坚硬，曾经有人拿来冒充象牙，其硬度可想而知。
濒临灭绝的非洲黑鹦鹉塞舌尔亚种群是塞舌尔的国鸟，叫声婉转动听，全世界也只有五月谷自然保护区（Vallée de Mai Nature Reserve）才能见到。它们通常在清晨和傍晚喂食，当地的导游会用口哨吸引黑鹦鹉过来给游客观赏。
塞舌尔鹊鸲属雀形目，鸫科，身长约18～28厘米。羽毛色彩斑驳，尾巴有点退化，像是缩小了的鹊尾巴常常向下垂，而且不停地煽动。羽毛色彩斑驳，尾巴有点退化，像是缩小了的鹊尾巴常常向下垂，而且不停地煽动。鹊鸲靠捕捉地面上的昆虫为生，叫声特别优美动听。
白玄鸥为白燕鸥属，这种体小(30厘米)的纯白色燕鸥，成鸟通体白色，仅眼圈为黑色。尾略呈叉形，外侧尾羽较第二、三枚尾羽为短，嘴甚细尖并略上翘。其种群生活在大西洋、太平洋及印度洋的海岛之上，择树而栖。
塞舌尔是世界上极少数几处海龟可以于白日在海岸产卵的地方，而每年海龟产卵季是也是岛上最重要的生态观测时段。除了马埃岛、普拉兰岛及拉迪古岛外，塞舌尔其他无人居住或规划为私人度假村、自然保护区的小岛都有濒危海龟前往固定地点产卵。
阿尔达布拉象龟是世界上体型第二大的象龟，也是地球上最长寿的动物之一。其原生于印度洋上的阿尔达布拉群岛，也是世界上第一支受国际保护的陆龟种群。由于个性温和，且能适应人工养殖的环境，目前在塞舌尔各处都能瞧见其巨大的身影。
